小乘佛教是沒有阿賴耶識的。大乘佛教的中觀派也不講阿賴耶識，因為中觀派的基礎來自於早期的大乘經典，早期大乘經典又來自於小乘經典。這時阿賴耶識經典還未產出。到了西元五世紀以後瑜伽派的出現，讓阿賴耶識的觀念受到重視。

有部阿賴耶識學者必鑽研的論叫做『瑜伽師地論』，是一位叫作無著菩薩的印度學者在禪定中到兜率天聽彌勒說法所著。瑜伽師地論其實是佛祖悟道後一千年才出現的....歷史上以彌勒為號招的宗教信仰是非常多的，白蓮教大概是最出名的了。

現今大乘修行者，較為上乘高深的修行，普遍即是以阿賴耶識的轉識成智為修行主調，少部分是以中觀為主調。八識來自於小乘的六識，是在六識後再加了末那識與阿賴耶識，並加上轉識成智概念，至此，已經與阿含經等小乘教義，成為了永不交集的平行線。