聲音療法主要是通過生理和心理兩個方面的途徑來治療疾病。

一方面，聲波頻率會引起人們生理上的反應。
聲音的振動頻率是一種物理能量，而適度的物理能量會引起人體組織細胞發生和諧共振現象，能使顱腔、胸腔或某一個組織產生共振，這種聲波引起的共振現象，會直接影響人的腦電波、心率、呼吸節奏等。

另一方面，聲波頻率也會引起人們心理上的反應。
和諧的聲音波能提高大腦皮層的興奮性，可以改善人們的情緒，激發人們的感情，振奮人們的精神。同時有助於消除心理、社會因素所造成的緊張、焦慮、憂鬱、恐怖等不良心理狀態，提高應激能力。

現代聲音治療先驅者之一，強納森.高曼在他的「聲音治療的七大秘密」一書中也提到，人體也是一個振動源，人體的每一個器官，骨頭，組織以及各個生理系統都有它自己的振動頻率。這些頻率加起來就組成了人的振動頻率。

人就像一個交響樂隊一樣，只要身體的一部分振動不和諧，身體就會出狀況。所以，當人體振動失調，或者某一部位振動失衡，跟著人體也會出現一些症狀，慢慢就產生了疾病。而聲音治療的原理在於聲音振動進入人體後，它能改變人體的振動頻率，使身體與之共振，改變失衡部位的振動頻率，使身體重新回到平衡狀態。

當聲音頻率傳入人體，人的生物節律得到調節後，組織細胞發生和諧的同步共振後，各個組織系統就處於一種良好的運動狀態，如心率快慢、呼吸節奏、脈搏起伏、胃腸蠕動，甚至肌肉收縮舒脹都收到良好的調節；和諧的聲波對中樞和內分泌系統是一種良性刺激，促進神經內分泌系統分泌出有益於健康的激素、酶類、乙醯膽鹼等生命活性質，促進人體的新陳代謝。

聲音療法還能夠減輕或消除身體的緊張，緩解各種疾病，比如：頭痛、胃痛等。同時，它還能夠刺激腺體分泌腺液抵抗病菌感染；當神經系統處於疾病的重壓下時，聲音療法還能夠讓神經系統平靜下來。身體跟心理是相互依存，相互影響的。

聲音能讓身體的細胞、腺體、器官以及各個循環系統高效運轉，人的神經系統一旦正常發揮其功能，全身就會隨之處於放鬆狀態，呼吸自然更為暢快；人的大腦一旦保持了清醒，感情就會得到昇華，也就可以擺脫消極情緒的困擾。