清嚴法師北上後，在台北縣新店碧潭的芊蓁路（即今之碧潭路），另創海藏寺。海藏寺的前身是棟民宅，清嚴法師只是略加整修而已，加上寺與一般民宅夾雜，若不留心，根本看不出來是間佛寺。清嚴法師選上這裡，乃是因為這裡前有新店溪，後有萬聖山，環境清幽，是適合修行的好地方之故。

從民國五十年到五十九年三月間，是清嚴法師住錫海藏寺的時期，除了以梵唄念佛接眾之外，清嚴法師主要是修苦行自勵～「苦行一輩子，芒鞋百衲破笠，若貧兒、若丐人」。在飲食方面，據說清嚴法師生前吃過最好的食物是豆腐，其他的食物乃是撿拾市場的棄葉或野生植物。在修行方面，清嚴法師以念佛為主，每天清晨二時即起，中午休息一小時，晚間十一時才就寢，平均每天僅休息四、五小時。如此清苦的生活長期以往，極可造成身體的傷害，清嚴法師在四十七歲的壯年早逝，或許和苦行有關。
清嚴法師生前最後一張照片，攝於圓寂前數日
(圖片：闞正宗提供)

清嚴法師早年住錫十普寺的時候，身體較肥胖，動作顯得不很敏捷。台灣有些出家眾因為飲食的關係，使得身體過度肥胖，而常常有罹患糖尿病或高血壓的症狀。清嚴法師因肥胖而引起高血壓的疾病，是極有可 能的。民國五十九年三月二十五日，清嚴法師依舊如往常一樣早起供佛早課，清晨四點多的時候，忽倒不起，弟子急忙上前扶持，才發現清嚴已圓寂了。從這突然的情況推測，清嚴極可能是因高血壓而引起腦溢 血（俗稱中風）而過世。加以當年三月時節春寒料峭，早起因溫差的關係，身體血壓常會因一時無法適應而發生危險，許多中、老年人常在冬季因腦溢血而死亡，在醫學上的統計是相當高比率。

據說清嚴法師往生前的一個月左右（二月中旬），有一天法會方歇，聽見外面出殯行列喧嘩而過，就告訴弟子說:「我死後讓我坐缸在寺裡，不要火化，六年後再開缸來看。」（我寂後於寺內院地合龕六載，然後開視）。佛弟子一般遺體的處理方式是用火葬（佛教稱荼毗），然後再撿拾舍利子藏於塔中，以肉身而保持不壞，在中國較有名的如唐六祖惠能、石頭希遷等人。我們以為清嚴生前會選擇坐缸的方式，應該是受慈航法師的影響。慈航圓寂於民國四十三年五月六日，原本根據慈航的遺囑是「三年後開缸」，但因負責「慈航法師永久紀念會」的道安法師以紀念堂及塔院未完成，力排眾議，到了民國四十八年五月十一日才開缸。慈航坐缸五年，清嚴坐缸六年，兩者相差不多。

慈航法師當年開缸，往汐止靜修禪院的道上車水馬龍，如此空前的盛況，在台灣的佛教界並不多見。這種死後因肉身完整而名聞遐邇，清嚴當年必了然於心。


清嚴法師圓寂後坐缸三天時攝
(圖片：闞正宗提供)
清嚴法師往生前一個月，據說已事先預定好了坐缸兩口，如果我們比較具和慈航的坐缸，其形式可說是沒 什麼差別。慈航是台灣第一尊以坐缸方式保存肉身不壞之人，他當年坐缸用的方式，清嚴加以模仿參考， 可說是一件極為自然的事。清嚴選擇坐缸是生前決定，方式是依慈航的模式，坐缸後所藉以乾燥防腐的措 施，毫無疑問的亦是仿照慈 航者。慈航當年是結伽趺坐，坐在缸內，坐下及身周圍，墊以適當的炭屑及石灰，用以吸取水份及防細菌 的滋長，以另一缸倒置，用漆布將兩缸口纏緊，以防紅外蟲蟻侵入。清嚴坐缸的方式又如何？據常明法師 （清嚴之弟子）表示：

「坐缸就是坐在大水缸，然後上面覆蓋另一大水缸，缸內則於置木炭、石灰、香包。……放置木炭，石灰、香包的目的是吸收水份。」

清嚴生前矚死後以坐缸的方式為之，和慈航十分相似，學習與模仿是可以斷定的。

清嚴的弟子先是將其遺骸盤坐於平日禪用的藤椅上，及至備妥坐缸後，才為清嚴穿上黑色海青、黃色袈裟 、頭戴鳳帽，兩缸覆合完成坐缸儀式。原本弟子的意思是將坐缸供奉於海藏寺中，但這和傳統習俗的殮葬方式不合，警方強制寺方需將坐缸移走。在不得已的情況下，才在台北市吳興街的拇指山暫厝，百日之後 又移厝於三張犁，並達一小木屋供奉。

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