12/21：清晨開始，警方在清泉崗機場部署約兩千名警力，拉起兩層封鎖線，封鎖中清路長達一公里，租借至少卅戶民宅屋頂監控，宛如戰地戒嚴。

上午針對抗議陳雲林行動，馬英九召集行政院和國安會等相關單位說明維安措施，指示要保護人民集會遊行的自由，只有在必要的情況之下，才要採取維安的措施。而江陳會所有行程都應該透明化避免民眾誤會，兩岸所簽署的協議都會全部公開。
海陸兩會下午公布大致行程，部分行程和規劃已有異動，原南投水里八八水災受災戶中繼屋行程喊停，可能改往新山村壽山橋現場訪視，原定日月潭遊湖行程取消。
預計行程，22日簽署三項協議。
23日陳雲林將出席苗栗縣長劉政鴻於西湖渡假村所舉辦的午宴，下午海協會代表團將參訪中科，陳雲林夫婦轉往三義木雕博物館、鎮瀾宮，晚間返回台中，接受市長胡志強晚宴招待。
24日上午陳雲林與江丙坤進行早餐會，海協會代表團前往南投，陳雲林將拜訪中台禪寺，探訪水里鄉的新山村災民，中午在日月潭涵碧樓午餐，下午江陳同遊日月潭景點，晚間在涵碧樓接受南投縣長李朝卿晚宴接待。
25日在涵碧樓舉行歡送式後，陳雲林即由日月潭抵台中航空站，搭機返回北京。

上午台中航空站警方讓中華統一促進黨人買機票進入機場，拉出紅布條高呼歡迎口號，，抗議民眾與歡迎馬拉扯衝突，員警包圍抗議人士，任由中華統一促進黨繼續拉布條、喊口號，引發議員不滿，痛批警察變成共匪的「走狗」，警方選擇性執法，清水警分局長郭瑞權坦承疏失。

中午12點23分陳雲林抵台，曾聲明要「開大門走大路」的陳雲林，為避開嗆聲群眾，未走航站大門，搭車從漢翔公司沙鹿廠區離開。其間警方刻意不斷調動警力，營造陳將從大廳出來的假象，躲過正門外民進黨人士的抗議。
陳雲林極力推崇胡志強，對帶給台中市民的不便表達歉意，稱願成為台中的代言人及推銷員。陳說：「與上次在台北比較，此次不同意見能夠平和理性處理，對社會各方面都有好處」。

下午原訂在台中市區的行程，萬和宮、科博館都在最後一刻取消，只參觀中台灣房價最高豪宅「聯聚信義大廈」，遇抗議民眾高喊「台灣、中國，一邊一國」。之後陳雲林改往台中亞緻大飯店，台中市府新聞局長曹美良堅稱原就如此規劃，沒有改行程。
台中市府派媒體專車讓記者隨行採訪，但媒體上車只能跟著前車在台中迷航，後當面怒嗆台中市長胡志強「市長，這是台灣，不是大陸！」台中市議員也痛批胡過去是「保密防諜」現在變成「保匪防自己人」。

下午開始，裕元花園酒店被各路人馬「圍陳」，民進黨市議員推出「一中一台」的氣球、台聯議員施放高空煙火、「海洋之聲」電台出動計程車、救台灣行動聯盟升台灣國旗，法輪功成員和在台藏人也在酒店周邊持標語表達抗議。

私自使用辣椒水噴灑民眾的警察，內政部次長簡太郎表示是因分局長遭民眾勒住脖子，員警才情急做出防衛，由於辣椒噴霧劑並不是警方的制式裝備，因此該員警已遭記大過處分，調離這次維安勤務。簡太郎也表示依警方判斷，20號台中遊行在活動最高峰時大約是3萬多人。台中市長胡志強日表示，市警局已採取懲處作為，將使用瓦斯噴霧器的宋姓員警記2小過懲處。

四次江陳會原本要簽署四項協議，下午進行預備性磋商後決定暫不簽署「避免雙重課稅和稅務合作協議」，四項協議三缺一，這是江陳會首度出現協議臨時破局。海基海協對外說法是「技術層面問題」，據了解應台商反彈及國家主權爭議有關。

傍晚民進黨台中市議會黨團要進入江陳會封鎖區內吃前一天訂好的羊肉爐，被警方阻擋，業者表示「今晚有營業」，但警察指揮官表示議員違法，要求警察「只可擋」，不可發生衝突，數位議員試圖把李明憲「拋入」警察陣內，試圖跳入封鎖區，但闖關未果。之後由業者「包羊肉麵線」出來給議員們「席地而吃」，證實警方強制封鎖區內商家無法營業。此家羊肉爐，因寒流過境生意正好，一天有十至廿萬業績，封鎖後沒客人上門，業者欲哭無淚。
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12/22：上午賴幸媛與雲林第二次見面，陳雲林改稱「幸媛」，賴幸媛依舊稱陳為「陳會長」，賴說這是對老朋友的稱呼，也是國際慣例。賴強調，兩岸和解不可能在軍事武力威脅的陰影下達成，呼籲中方聆聽不同聲音。陳雲林回應，只要做對的事，就要「咬定青山不放鬆」，不能因反對漂移浮動、猶疑不前。

下午第四次江陳會簽署三項協議，宣布ＥＣＦＡ及保護智慧財產權議題，列為第五次會談協商議題。兩岸租稅協議在花了4百萬廣告後確定喊卡，主因中國要改以香港模式，去中華民國主權，以及台灣大企業家郭台銘等十多人向馬政府表達反對意見。其他三項為兩岸漁船勞務合作協議、農產品檢驗與中國同標準、兩岸標準計量檢驗認證合作協議。

江丙坤對中方未將兩會過去簽署九項協議執行，如每日來台觀光人數、空運航班班數不足、三聚氰胺案件後續處理、台灣重大經濟罪犯未能遣返等，向陳雲林表態要求中方處理，陳指有些是延伸問題，有些是協議要落實的問題，雙方還可繼續協商。

本土團體、綠營人士施放沖天炮、空飄氣球「突破」封鎖，擺出「假飛彈」瞄準飯店，出動「電子花車」遊街，並在會場外演講，向陳雲林傳達「台灣中國，一邊一國」的訴求。

統聯客運中港轉運站原預計停止營運到24日中午，因乘客怨聲載道，加上抗議民眾減少，警方下午一時協調站內抗議人士撤離，讓轉運站提前恢復運作。