1895年1月，陆皓东接到孙中山回国的消息，立即与其他革命志士赶赴香港同孙中山会合，商讨举义大计。2月21日，他参加了孙中山组织的香港兴中会总部，成为孙中山忠诚的战友和得力助手。3月，清政府在中日战争中战败求和，民情激愤，兴中会总部决定利用这一有利时机，发动武装起义，袭取广州作为革命根据地。陆皓东在兴中会总部召开的干部会议上指出，起义势在必行，不能再有丝毫动摇。会议决定“分道攻城”之策，约定时期，召各地民团会党，分顺德、香山、北江三路，会集广州，同时举事。陆皓东在会上还提出：为了团结同志，号召天下起而响应，一定要打出革命派自己的旗帜，以示与清朝决裂。这个建议获得孙中山和其他革命志士的热烈支持。陆皓东受孙中山委托设计革命军旗图案。他通宵达旦地思考，终于设计出了青天白日旗（即后来的国民党党旗）。这面军旗，成为发动广州起义的标志。